災害時は、放浪状態(迷子)や負傷したペットの救護や、飼育管理しながら元の飼い主への返還をしたり、新しい飼い主への譲渡をする必要があります。
避難者の皆さんは、避難所運営だけでも大変でそこまで手が回らないので、各種支援団体や自治体の力を借ります。

保護する為に何をする必要があるか具体例を挙げると、同行避難したものの、飼い主の高齢化や持病などの様々な理由で、自身での飼育管理ができなかったり、飼い主との連絡が取れない場合は、一時預かりを行う必要があります。
ペットの救護·一時預かり·飼育·返還·譲渡を行える、体制整備が必要です。
体制整備が上手くできたとしても、譲渡するのが仔犬や仔猫なら、譲渡先は早く見つかりますが、成犬(特に大型犬)や成猫(全く懐かない猫)や体に障がいなどがあると、譲渡が困難になる事が予想されます。